前沿 | 全球基因组生物多样性(GGBN)宣布2022年收集基因组样本数据
近日,中国生物多样性保护与绿色发展基金会(简称中国绿发会,绿会)国际部从全球基因组生物多样性(GGBN)秘书处获悉,2022年通过GGBN数据门户网站发现了253,163个细胞组织样本、233,503个DNA样本和2307个环境样本。
非模式生物的基因组样本在从发育生物学、生物多样性分析到生物保护的广泛研究中变得越来越重要。基因组样本的定义、描述、质量、凭证信息和元数据都需要数字化,并在科学界传播。在当今日益增长的生物信息学时代,这些信息需要简洁和一致,以便互补的数据聚合器能够轻松地将数据库映射到彼此之间。为了方便的信息交换对基因组样本及其派生的数据,全球基因组生物多样性联盟(GGBN)数据标准的目的是提供一个平台基于记录协议,促进有效的共享和使用基因组样本材料和相关样品信息一致的方式。它为来自世界各地的生物多样性生物库提供知识共享、合作研究和改进实践的平台,从而为保护全球生物多样性和遗传多样性做出贡献。
中国绿发会是GGBN的成员机构,为推动中国深度参与全球生物多样性治理,绿会国际部现将相关内容整理发布,供读者参考。
全球基因组生物多样性联盟(GGBN)在2022年12月1日宣布,今年通过GGBN数据门户网站发现了253,163个组织样本、233,503个DNA样本和2307个环境样本。提供数据的机构包括斯坦哈特自然历史博物馆(Steinhardt Museum of Natural History)、亚历山大·冯·洪堡生物资源研究所Alexander von Humboldt Institute for Research on Biological Resources)、贾瓦哈拉尔·尼赫鲁热带植物园和研究所(Jawaharlal Nehru Tropical Botanic Garden and Research Institute)、美国国家自然历史博物馆(National Museum of Natural History),和莱布尼茨生物多样性变化分析研究所(Leibniz Institute for the Analysis of Biodiversity Change)。
其中,斯坦哈特自然历史博物馆已通过GGBN数据门户网站发现了10086个细胞组织样本,包括669个属,其中76个属是GGBN的新属。斯坦哈特自然历史博物馆收藏了世界上最大、最重要的东地中海脊椎动物,包括海洋和淡水脊椎动物,以及沙漠和地中海植被。馆中包含数千个分类群的细胞组织样本:从地理变体到物种,以及其他任何地方都没有的更高分类群。(来源:澎湃新闻)